Η Πανεπιστημιούπολη Βουτών στο Ηράκλειο εξυπηρετείται από τις λεωφοριακές γραμμές "ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΑΚΟ ΝΟΣΟΚΟΜΕΙΟ" και "ΙΤΕ" με αφετηρία το Λιμάνι και το Αεροδρόμιο Ηρακλείου, διαμέσου των κεντρικών λεωφόρων της πόλης. 

Η Πανεπιστημιούπολη Γάλλου στο Ρέθυμνο εξυπηρετείται από τη γραμμή "ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ" με αφετηρία τον Κόμβο Αμαρίου, διαμέσου της κεντρικής λεωφόρου της πόλης.